以实验教学改革带动实验室建设的过程中，把实验教学与理论教学放在同等重要的位置。鉴于“中心”教学覆盖药学、工业制药、药物分析、医学化学实验等多学科门类，根据各学科专业的要求，构建不同层次的的实验课程教学模式；合理安排实验顺序；注意理论教学与实验教学的内在联系，使理论课与实验课有机结合，互相促进。
    正确的理论是人们对事物发展过程必然性的正确认识，人们探索和掌握理论的目的是用以指导社会实践；人们对事物发展过程认识的正确与否，必须在实践中加以检验，通过理论-实践-再理论，使自己对事物的认识与事物发展过程趋于一致。正确理论指导下的实验必然获得预想的结果。因此，药学实验教学中心应该在有限的大学学习时间内，首先训练学生掌握正确的单元操作（基本操作技能实验），为发展打下坚实基础；其次提高学生的实验能力（提高型实验），即让学生熟悉各单元之间的相互关联（综合性实验）、怎样能自主开展实验（设计性实验）以及怎样利用实验去解决生产实践中的问题（应用性实验）；最后目的是要让学生根据自己掌握的基本原理，由理论推演事物演变过程，然后在实践中加以检验（创新型实验），树立学生的创新意识，培养学生创新能力，增强毕业生社会综合竞争力，为我国医药事业的良性发展锻造可用之材。在这样的思想指导下，逐渐形成了我们实验教学的理念：以教师为主导，以学生为中心，以激发学生学习积极性为出发点，以培养学生创新能力为目的，按照科学研究的规律、思维、方法为主线索组织实验教学，促进学生自我选择学术发展方向、自我设计知识结构、自我完善科研技能。
    在上述实验教学理念的指导下，药学实验教学中心的教学定位是：在学校指导思想下，以实验教学改革带动实验室建设的过程中，把实验教学与理论教学放在同等重要的位置，坚持以学生为本，围绕医学生后续课程深入学习及临床实践过程要求和药学药物研究、开发和应用的实践过程，遵循认知规律，由简单到综合，由综合到创新，通过实验仪器的正确使用、准确测量和日常维护、实验方案的设计、数据采集、记录与处理和实验结果的分析与讨论，培养科学的世界观和方法论，训练严谨的科学作风，使学生学习科学实验的基本知识和基本方法，掌握实验操作基本技能；通过专业课程提高型实验和创新型实验的训练，激发学生的探索精神和创造性思维，教学中始终将实验知识的传授和实践能力、创新能力的培养有机地结合起来，注重学生知识、能力、素质的协调发展。
    药学实验教学中心在教学中从“质”上下工夫，首先对一年级学生主要加强实验基本技能训练，严格规范学生的实验基本操作，使实验基本技能训练系统化；对二年级以上学生增大开设提高型实验比例，培养学生发现问题、分析问题、全面考虑问题和解决问题的能力；对三年级以上的学生，增设设计性实验；对部分学有余力的同学，利用他们强烈的探索精神和求知欲，让他们根据兴趣，自由选择我院教师或与我院密切合作的研究院所、制药企业的研究课题，提前开展创新型实验；学生进入毕业环节后，全面实施创新型实验，培养学生创新思维和能力。